稻田综合种养殖系统，其主要任务是在保证稻谷丰收的前提下，最大限度的产出商品鳖。因此，共生稻田的养殖工程必须尽量能满足鳖的生态条件。
(1)稻田的选择：鳖虽是水陆两栖，但基本上生活在水中，因此需要有充沛的水源和良好的水质环境。水源最好是河流、水库、湖泊等水域的地面水。地面水水温较高，溶氧充足。在矿区或被有毒工业为水、农药等污染的水，不能用作水源。
养鳖稻田的底质以壤土为好。沙质土保水性差，粘土虽能保水，但通气性差，有机物分解迟缓，水质容易变坏。壤土保水性和通气性都较好，是进行稻田养鳖的理想底质。养鳖稻田应选择在地面开阔、地势平坦、避风向阳、安静的地方，要能排灌自如，易干易涝的地方，不利于稻田养鳖。
(2)稻田养鳖基础设施：养鳖稻田的设施除了应用稻田养鱼的一般设施外，特别要加强的是防逃设施，因鳖善攀缘，易逃逸。因此养鳖稻田要建造良好的防逃设施。防逃墙的高低，按稻田中养鳖个体的大小而分，一般30—60厘米不等。
防逃墙的顶部一定要出檐，出檐的宽度以向池内伸出10—15厘米为宜。防逃墙要建在四周的田埂上。必须深入田埂20厘米以上，材料有砖墙、水泥板、塑料板或玻璃钢瓦等，进排水口的防逃栅要坚固。也可在进出水管上套上防逃筒，防逃筒用钢管焊成，根据鳖的大小钻上若干个排水孔，使用时套在排水口或进水口管道上即可。
稻田养殖工程采用田凼式、宽沟式、回形沟式都可以，但以田凼式管理最为方便。另外，根据鳖的生理需要，应在田凼上搭设晒台，供甲鱼爬出水面晒背之用。晒台可设置在田凼的中央水面，也可靠近凼边，用竹木搭成拱形，铺上木板或竹帘，晒台周边没入水面以下30厘米，以便甲鱼能上晒台，晒台面积可占田凼面积的1/5左右。也可在田凼的北边，用水泥预制板做成与水面成30度角的斜坡，当作晒台，效果也很好。
在田凼的南边水面以上搭设饲料台，台宽0.5米，长2米，饲料台3/5没入水中，饲料投在露出水面的饲料槽中。饲料台的数量可依鳖的数量来确定，一般每50只幼甲鱼，设一个饲料台。也可利用晒台充当饲料台，在晒台水面以上，设置饲料槽即可。
