在集约化养殖条件下，引起疾病的原因主要有：水质，放养密度，饵料的投喂量与质量，捕捉运输中操作损伤等。养殖池水质恶化主要是投饵过量、残饵过多、粪便的大量沉积以及水源不良等原因所引起。一旦水质恶化就会导致病原体的大量滋生，从而引发各种疾病。另外，恶化的水质还会对山瑞鳖产生直接危害。放养密度的高低亦是引起疾病的一个重要因素。因放养密度大，若投饵不足，山瑞鳖会相互撕咬、残食，继而感染细菌引发疾病。饵料质量得不到保证，山瑞鳖的营养要求得不到满足，也会引起生理机能失调，抗病能力降低，引起营养缺乏症或感染其它疾病。捕捉、运输过程中受损伤，如果没有处理，也会招致感染疾病。
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